Calculadora de Peso Molecular de Proteínas

Categoría: Biología
- March 21, 2025
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El peso molecular de una proteína se calcula utilizando la suma de las masas isotópicas promedio de sus residuos de aminoácidos:

\[ PW = \sum (n_i \times PW_i) - (n_{péptido} \times PW_{H_2O}) \]

Donde:

  • \(n_i\) = Número de cada aminoácido en la secuencia
  • \(PW_i\) = Peso molecular de cada aminoácido
  • \(n_{péptido}\) = Número total de enlaces peptídicos
  • \(PW_{H_2O}\) = Peso molecular de una molécula de agua (18.02 Da)

¿Qué es la Calculadora de Peso Molecular de Proteínas?

La Calculadora de Peso Molecular de Proteínas ayuda a determinar el peso molecular de una proteína basado en su secuencia o composición de aminoácidos. También calcula propiedades adicionales como el punto isoeléctrico teórico (pI), el coeficiente de extinción, la hidrofobicidad (puntaje GRAVY) y la carga neta a pH 7.

Cómo Usar la Calculadora

La calculadora ofrece múltiples formas de ingresar datos de proteínas:

  • Método de Secuencia: Ingrese la secuencia de la proteína utilizando códigos de aminoácidos de una letra.
  • Método de Composición: Ingrese manualmente el conteo de cada aminoácido.
  • Opciones Avanzadas: Aplique modificaciones como acetilación, enlaces disulfuro o modificaciones terminales.

Características Clave

  • Calcula el peso molecular tanto en Dalton (Da) como en kilodalton (kDa).
  • Determina el pI teórico basado en los valores de pKa de los aminoácidos.
  • Calcula el coeficiente de extinción para la absorbancia UV a 280 nm.
  • Estima la hidrofobicidad utilizando el puntaje GRAVY.
  • Considera modificaciones personalizadas como fosforilación, metilación y amidación.

¿Por qué es Importante el Peso Molecular de las Proteínas?

Conocer el peso molecular de una proteína es crucial para:

  • Análisis de electroforesis (SDS-PAGE, Western blotting).
  • Identificación por espectrometría de masas.
  • Purificación de proteínas y cromatografía.
  • Estudios estructurales y funcionales.

Preguntas Frecuentes

¿Cómo se calcula el pI teórico?

El punto isoeléctrico (pI) es el pH en el que la proteína no tiene carga neta. Se calcula utilizando la ecuación de Henderson-Hasselbalch:

\[ pI = \frac{pKa_{pos} + pKa_{neg}}{2} \]

¿Qué es el coeficiente de extinción?

El coeficiente de extinción se calcula utilizando el número de residuos de triptófano (W), tirosina (Y) y cistina (C):

\[ \varepsilon = (n_W \times 5500) + (n_Y \times 1490) + (n_C \times 125) \]

¿Cómo maneja la calculadora las modificaciones?

La calculadora permite aplicar varias modificaciones post-traduccionales, que se suman o restan del peso molecular de la proteína.

¿Qué es el puntaje GRAVY?

El Puntaje Promedio de Hidropatía (GRAVY) es una medida de la hidrofobicidad de la proteína. Se calcula como:

\[ GRAVY = \frac{\sum (Hidropatía_{AA} \times n_{AA})}{Total\ de\ Aminoácidos} \]

¿Por qué se incluye la molécula de agua en el cálculo?

Cada formación de enlace peptídico resulta en la pérdida de una molécula de agua, por lo que la masa total se ajusta en consecuencia.

Conclusión

La Calculadora de Peso Molecular de Proteínas es una herramienta valiosa para investigadores y estudiantes en bioquímica y biología molecular. Ya sea analizando la estructura de proteínas, realizando experimentos o interpretando resultados, esta herramienta proporciona propiedades moleculares esenciales de manera rápida y precisa.